Trong trận đấu giữa V.HP và N.SG, do không hài lòng với màn trình diễn của thày trò HLV Nguyễn Đình Hưng, các CĐV đội chủ nhà đã ném vật thể lạ xuống sân. Căn cứ vào Điều 68 khoản 2, Ban kỷ luật VFF xử phạt BTC trận đấu của V.HP 20 triệu đồng. Bên cạnh đó, Ban kỷ luật VFF cũng ra quyết định xử phạt ở giải hạng Nhất – Tôn Hoa Sen 2012 trận đấu giữa CLB trẻ HN với HV.AG. Do có tới 5 cầu thủ nhận thẻ vàng, đội khách HV.AG bị phạt 2 triệu đồng. Đội chủ nhà CLB Trẻ HN cũng có 5 cầu thủ nhận thẻ và nhận mức phạt 3 triệu đồng.
Lịch truyền hình trực tiếp vòng 3 Super League
CLB Hà Nội – K.KH, sân Hàng Đẫy, lúc 16h10, ngày thứ Bảy 14/1/2012, do VTV sản xuất, ghi hình và phát sóng trên kênh VTV2, và thông sóng với các đài địa phương.
SHB.ĐN – HA.GL, sân Chi Lăng, lúc 16h30, ngày thứ Bảy 14/1/2012, do VTV sản xuất, ghi hình và phát sóng trên kênh VTV3.
Thanh Hóa – B.BD, sân Thanh Hóa, lúc 16h10, ngày thứ Bảy 14/1/2012, do Đài truyền hình Việt Nam (Trung tâm truyền hình cáp VCTV) trực tiếp trên kênh VCTV.
K.KG – SG.FC, sân Kiên Giang, lúc 16h30, ngày thứ Bảy 14/01/2012, do Đài Phát thanh – Truyền hình Kiên Giang trực tiếp trên kênh Kiên Giang.
SLNA – HN.T&T, sân Vinh, lúc 16h00, ngày Chủ nhật 15/01/2012, do VTV sản xuất, ghi hình và phát sóng trên kênh VTV3.
V.HP – CS.ĐT, sân Lạch Tray, lúc 16h10, ngày chủ Nhật 15/01/2012, do VTV thực hiện sản xuất, ghi hình và phát sóng trên kênh VTV2 và thông sóng với các đài địa phương.
N.SG – V.NB, sân Thống Nhất, lúc 18h30, ngày Chủ nhật 15/01/2012, do Đài truyền hình TP.HCM (HTV) trực tiếp trên kênh HTVC và NCM.
