Theo đó, tiếp nối sự thành công tại mùa giải 2015 thì Trưởng BTC Giải VĐQG TOYOTA 2016 vẫn là Ông Nguyễn Minh Ngọc – Phó Tổng Giám đốc.
Các Phó Trưởng Ban gồm có Ông Nguyễn Văn Mùi – Trưởng Ban Trọng tài VFF và Ông Nguyễn Ngọc Thanh – Cục trưởng Cục tham mưu, tác chiến K20. Cùng các Ủy viên gồm có: Ông Nguyễn Trọng Hoài – GĐĐH CLB FLC Thanh Hóa; Ông Nguyễn Húp – GĐĐH CLB QNK Quảng Nam; Ông Đặng Xuân Huy – Chủ tịch CLB Đồng Tháp; Ông Hoàng Chuyên Cần – Trưởng Phòng HCNS VPF; Ông Nguyễn Đức Mạnh – Trưởng phòng TT&TT VPF; Bà Nguyễn Thanh Tú – Phó Trưởng phòng PL&TCCT VFF và Bà Hà Thị Duyên – Trưởng phòng TCKT VPF.
